Программа XRAYPOL доработана и теперь по новой универсальной программе (WWW)-XRAYPOL возможны расчеты всех входных и вспомогательных файлов (BDQ-Co, BDQ-Cu, BDI, BDP, INF, DAT). Кроме того, XRAYPOL позволяет редактировать базовый BDM-файл и вспомогательный DAT-файл. Эта цепь расчетов предназначена для модифицируемых базовых BDM-файлов. В настоящее время реализована в виде локального апплета (запускается в окне браузера), позволяет проводить как единичные, так и групповые расчеты (вплоть до всего объема Фонда), проводится ее интеграция в WWW-МИНКРИСТ, где она будет открыта для Международного Пользователя.
Итак, Пакет Разработчика WWW-МИНКРИСТа (находясь в off-line) позволяет функционировать WWW-МИНКРИСТу в обычном статическом режиме. Каждая карточка обеспечивается расчетными входными импортируемыми файлами и, с помощью WWW-MIXIPOLa и WWW-CRYSTPICa, конкретной моделью кристаллической структуры и конкретной рентгенограммой.
Новый доработанный универсальный XRAYPOL, позволяет редактировать базовые BDM-файлы и производить, на основе уже модифицированных базовых файлов, все необходимые расчеты по MIXIPOLу и CRYSTPICу. Таким образом, расчеты становятся динамичными. Например, в недалеком будущем Пользователь сможет менять заселенность позиций структуры конкретного минерала, т.е., менять его состав, редактируя BDM-файл, и получать модифицированную расчетную рентгенограмму, которую далее сравнивать с экспериментальной. Эти возможности реализованы в виде off-line апплетов и сейчас интегрируются в on-line версию.
КРИСТАЛЛИЧЕСКОЕ ПРОСТРАНСТВО МОЖНО ОРГАНИЗОВАТЬ в СМЕШАННОМ ШАРОВОМ И ПОЛИЭДРИЧЕСКОМ ИЗОБРАЖЕНИИ НА ОСНОВЕ ЛЮБЫХ АТОМОВ В СТРУКТУРЕ, НЕ СТРОГО ПРИВЯЗЫВАЯСЬ К ТРАДИЦИОННОМУ КАТИОННО-АНИОННОМУ ИЗОБРАЖЕНИЮ
Метод особенно эффективен для сложных "неправильных" бескислородных структур (например, фосфиды, сложные сульфиды и др.).
Главный принцип такого подхода: ЛЮБОЙ АТОМ В СТРУКТУРЕ (или несколько атомов) МОЖНО ВЫБРАТЬ за УСЛОВНЫЙ "КАТИОН", а остальные считать "анионами". Ниже мы приводим пример расчетов моделей структуры ТУСЕКИТА в традиционном и новом изображении (нажатие на картинку даст увеличенное изображение в новом окне).
Заметим при этом, что на конечный вид структурного изображения влияет выбор:
- координаторов пространства (условных "катионов")
- координат, количества, сочетания, координационных чисел этих "катионов"
|
Варианты новых форм графического изображения модели структуры минерала Tucekite | |||
|---|---|---|---|
 Тусекит-1: Катионы - сурьма (две позиции) |  Тусекит-2: Катионы - сурьма и никель (по одной позиции) |  Тусекит-3: Псевдокатионы (координатор пространства) - сера (две позиции) |  Тусекит-4: Катионы: сурьма и никель - Sb - без полиэдра |
|
Варианты традиционных форм графического изображения модели структуры минерала Tucekite | |||
 TUCEKITE-1: Катионы - сурьма и никель |  TUCEKITE-2: Катионы - сурьма и никель (Ni полиэдр скрыт) |  TUCEKITE-3: Катионы - сурьма и никель (Sb полиэдр скрыт) |  TUCEKITE-4: Катионы: сурьма и никель - Sb - без полиэдра |
2008 год
- Выполнен план по увеличению Информационного Фонда Локального и WWW-вариантов МИНКРИСТа. Введено 320 новых записей. По количеству записей МИНКРИСТ перешел за 7-тысячный рубеж и на 1 января 2009 г. насчитывает 7280 записей.
- Разрабатывается новый формат Информационной карты по минералу.
Выделяются три части и идет подготовка к реализации нового облика
МИНКРИСТа:
а) Основные базовые данные (MAIN DATA);
б) Дополнительные данные, в том числе, расчетные - кристаллографические и кристаллохимические (ADDITIONAL DATA);
в) ON-LINE Программный Пакет (Java-applets) - MIXIPOL,CRYSTPIC (3D), XRAYPOL. - Специально разработана процедура сверки импортируемых в Локальный и WWW-вариант записей (по номеру карточки и имени файла), которая позволяет сохранять полную идентичность их фондов и постоянство номеров карточек по минералам.
- Выполнен необходимый объем работ по обновлению Программного Пакета
Разработчика.
Основная расчетная программа XRAYPOL (Java applet) отлажена и выверена на действительность расчетов в рамках 350 пространственных групп. Основной Базовый Файл (BDM) и его сателлиты (BDI, BDQ-Co, BDQ-Cu, BDP, INF) рассчитываются по новому WWW-XRAYPOL и импортируются в WWW-МИНКРИСТ по модернизированной программе импорта уже на новый Сервер Баз данных ИЭМ РАН. - Теперь по новой универсальной программе WWW-XRAYPOL организованы расчеты всех входных и вспомогательных файлов (BDQ-Co, BDQ-Cu, BDI, BDP, INF, DAT) для программ WWW-MIXIPOL и WWW-CRYSTPIC. Кроме того, XRAYPOL позволяет редактировать базовый BDM-файл и вспомогательный DAT-файл. Эта цепь расчетов предназначена для модифицируемых базовых BDM-файлов будет встроена в МИНКРИСТ и открыта для Международного Пользователя.
- В первой половине 2008 г. программно-серверное обеспечение WWW-MINCRYSTа полностью адаптировано для работы на новом Сервере Баз данных ИЭМ РАН (Intel CoreDuo 2 1.8 ГГц, 2 Gb RAM, ~1 Tb HDD)
2007 год
- Выполнен план по увеличению Информационного Фонда Локального и WWW-вариантов МИНКРИСТа, извлекаемого как из
специальной литературы (кристаллографические и минералогические журналы), так и через доступные в ИНТЕРНЕТ электронные
формы специальных файлов и специальных журналов. Введено более 300 новых записей.
По количеству записей (6951) МИНКРИСТ вплотную подведен к 7-тысячному рубежу. - Выполнена полная идентификация Информационного Фонда Локального и WWW-вариантов МИНКРИСТа путем глобального импорта записей из локального варианта в сетевой. Заново рассчитаны и введены в WWW-MINCRYST более 40 тысяч файлов (BDM, BDI, BDQ-Co, BDQ-Cu, BDP, INF) x 7000]. Возникшие "ножницы" - накопившиеся различия в именах файлов и номерах карточек обоих вариантов √ были ликвидированы. Информационные Фонды обоих вариантов МИНКРИСТа сделаны действительно идентичными. Открылась реальная возможность сделать номер карточки МИНКРИСТа постоянным. Связка двух вариантов МИНКРИСТа совершенно необходима и диктуется тем, что программный Пакет Разработчика пока ориентирован на Локальный вариант.
- Начата работа по переводу Программного Пакета Разработчика в рамки WWW-МИНКРИСТа с прицелом на передачу части полномочий и расчетов Разработчика √ Международному Пользователю. С этой целью разработана для введения в состав WWW-MINCRYSTa Java-версия главной расчетной программной связки WWW(TRANS + XRAYPOL).
- В стадии разработки программа-диспетчер WWW-MINCALC, с помощью которой в рамках WWW-МИНКРИСТа по связке
WWW(TRANS+XRAYPOL) будут организованы интерактивные расчеты всех входных и вспомогательных файлов
(BDQ-Co, BDQ-Cu, BDI, BDP, INF, TRANS.DAT) для уже встроенных программ WWW-MIXIPOL и WWW-CRYSTPIC.
Диспетчер будет доступен Пользователю для выполнения прямых расчетов модифицируемых моделей кристаллических структур и полно-профильных рентгенограмм. - В связи с встройкой в WWW-МИНКРИСТ новых программных элементов выполнен необходимый объем работы по совершенствованию англоязычного и русскоязычного интефейсов к WWW-МИНКРИСТу.
- Продолжалась работа по редакции Информационного Фонда и приведение названий минералов в соответствие с номенклатурой ИМА.
- В IV-ом квартале 2007 г. приобретен и установлен новый сервер Баз данных ИЭМ РАН. Соответственно WWW-МИНКРИСТ в составе программно-серверного обеспечения переведен на новый сервер, что безусловно способствует обеспечению надежного постоянства доступа Международного Пользователя к WWW-МИНКРИСТу.
2006 год
- Выполнено задание по наращиванию Информационного Фонда, который на 1 января 2006 г. составил 6630 записей в WWW- и L-вариантах МИНКРИСТа. За 2006 г. введено 300 новых записей. Все записи проверены на свое главное свойство - точность представления кристаллической структуры - расчетом межатомных расстояний и координационных чисел.
- Завершена разработка и реализация русскоязычного варианта WWW-МИНКРИСТа с полным набором функций, аналогичных англоязычному варианту. Русскоязычный интерфейс оперирует полным списком русских названий минералов, дублируемых английскими названиями. Оба варианта идентичны в информационном отношении. Сформирован общий список русских названий минералов, структуры которых расшифрованы и введены в WWW-МИНКРИСТ (более 2500).
- Усовершенствовано общее управление Информационным Фондом русскоязычного и англоязычного вариантов WWW-МИНКРИСТа. В отдельное управление с соответствующим поисковым интерфейсом выделены неорганические соединения, не являющиеся минералами (в основном, силикаты и окислы - около 6%)/.
- Разработан и реализован WWW-MixiPol (2006) - 3D-Java-APPLET - новая программа расчета и графического изображения полных квазиреальных рентгенодифракционных профилей поликристалл-рентгенограмм фаз и их смесей.
- Программа используется в двух вариантах.
- MixiPol-1 считает и изображает профиль поликристалл-рентгенограммы для фазы в соответствующей карточке Базы данных WWW-МИНКРИСТа.
- MixiPol-2 считает и изображает профиль поликристалл-рентгенограммы смеси фаз по списку, сформированному Пользователем извлечением из Базы данных WWW-МИНКРИСТа. Длина волны, CuK-alpha или CoK-alpha, выбирается Пользователем.
WWW-MixiPol позволяет Пользователю выделять и детализировать угловые интервалы рентгенограммы, вводить текстуру, менять концентрации компонент смеси и, тем самым, делает возможной полуколичественную оценку концентрации фазы-компоненты в смеси визуальным сравнением сформированной рентгенограммы-модели с экспериментальной рентгенограммой.
2005 год
- На 1 января 2006 г. Информационный Фонд насчитывает 6330 записей. За 2005 год введено 300 новых записей. Все записи проверены, как обычно, на свое главное свойство - точность представления кристаллической структуры - расчетом межатомных расстояний и координационных чисел.
- В новом разделе WWW-МИНКРИСТа, посвященном кристаллохимической характеристике минералов и их структурных аналогов - потенциальной энергии решетки, соответствующие расчеты произведены для второй тысячи кристаллических фаз. Теперь WWW-MINCRYST содержит 2000 кристаллических фаз с рассчитанной потенциальной энергией решетки.
- Разработан и реализован WWW-CrystPic (2005) - новая программа изображения моделей кристаллических структур как в шарах-сферах, так и в полиэдрах - на основе JAVA-технологии. Впервые в открытом доступе Международному Пользователю предоставлена возможность изучать анимированные катионные мотивы, определяющие тип и характер 6300 кристаллических структур, в выразительном полиэдрическом представлении
(см. Video Clip - http://database.iem.ac.ru/mincryst/video.html)
2004 год
- На 1 января 2005 года Информационный Фонд WWW-МИНКРИСТа достиг рубежа в 6000 записей. За 2004 год введено 300 новых записей.
- Открыт новый раздел WWW-МИНКРИСТа, касающийся кристаллохимической характеристики минералов - потенциальной энергии решетки. Соответствующие расчеты выполнены для 1000 минералов и их структурных аналогов (см. "Энергия решетки" в Меню для Карточки по минералу).
- Информационный Фонд классифицирован в соответствии с новейшей кристаллохимической классификацией минералов по М. Чириотти (M.Ciriotti). Практически всем минералам и их структурным аналогам приписаны формулы структурных типов (structure-type formula), характеризующие высшие таксоны классификации (семейство или группа) и соответствующие низшие таксоны (группа или подгруппа, серия, родственная структура - related structure).
- В рамках работы по приведению названий минералов в WWW-МИНКРИСТе, запасенных ранее по оригинальным источникам, в соответствие с номенклатурой Международной Минералогической Ассоциации (IMA) 60 минералов были переименованы.
- В рамках работы по совершенствованию интеграции WWW-МИНКРИСТа в международную сеть минералогических Баз данных разработана и реализована процедура периодической OFF-LINE актуализации соответствующих ссылок для минералов, включенных в Фонд WWW-МИНКРИСТа. Необходимость такой процедуры связана с наличием или отсутствием соответствующих записей в той или иной минералогической Базе данных.